تشتمل وزارة الأوقاف والشؤون الإسلامية بالإضافة إلى ديوان الوزير على إدارة مركزية ومصالح خارجية.
وتضم الإدارة المركزية ما يلي:
- الكتابة العامة ويشرف على تسييرها السيد نور الدين معنا;
- المفتشية العامة ويشرف على تسييرها السيد عبد الرحيم الكرعي؛
- هيئة المراقبة المالية المركزية ويشرف على تسييرها السيد مصطفى قرشي؛
- هيئة المراقبة المالية بنظارات الأوقاف وتتكون من المراقبين الماليين المحليين بمختلف نظارات المملكة؛
- شساعة النفقات ويشرف على تسييرها السيد علي أولحاج.
- المديريات
- مديرية الأوقاف ويديرها السيد عبد الهادي ارزيقي;
- مديرية الشؤون الإسلامية ويديرها السيد ياسين ححود;
- مديرية المساجد ويديرها السيد أحمد عيسي;
- مديرية تدبير شؤون القيمين الدينيين ويديرها السيد مولاي عبد الواحد غنضور;
- مديرية التعليم العتيق ومحو الأمية بالمساجد ويديرها السيد مبارك بتها؛
- مديرية الشؤون الإدارية والتعاون ويديرها السيد محمد مقر;
- مديرية الشؤون القانونية وتديرها السيدة الزهرة الدويعيسي.
وتشمل المصالح الخارجية على:
- نظارات الأوقاف
- مندوبيات الشؤون الإسلامية