تشتمل الوحدات الإدارية المركزية لوزارة الأوقاف والشؤون الإسلامية إلى جانب ديوان السيد الوزير، والكتابة العامة، والمفتشية العامة; على 7 مديريات و30 قسما و 109 مصلحة; وفيما يلي رسم هيكلي بهذه الوحدات الإدارية إلى غاية سنة 2016:
هيكلة وزارة الأوقاف والشؤون الإسلامية لعام 2016
