يترأس قسم الميزانية والمحاسبة التابع لمديرية الشؤون الإدارية والتعاون بوزارة الأوقاف والشؤون الإسلامية السيدة لبنى الصلحاوي، ويتألف القسم من المصالح التالية:
- مصلحة الميزانية والمحاسبة وتترأسها السيدة سليمة قسيـوي
- مصلحة الأدوات والمعدات ويترأسها السيد عبد الحميد برطال
- مصلحة الصفقات وتترأسها السيدة أمال حماوي
- مصلحة التدبير المندمج للنفقات وتترأسها السيدة مريم غيوغي
يختص قسم الميزانية والمحاسبة بنشر توجيهات إعداد كل من الميزانية العامة والخاصة للوزارة بتنسيق مع مختلف المديريات المركزية، ومركزة التوقعات وملاءمتها مع كراسة الميزانية، وكذا تدبير الصفقات العمومية وتوفير اللوجستيك لمختلف الوحدات الإدارية.